¿Qué marcador utilizar?
La selección de la metodología para obtener los marcadores moleculares no es cosa de moda; depende más bien de los objetivos y necesidades del trabajo. Por ejemplo, para determinar la variación de una población, quizás con un simple análisis de isoenzimas se pueda obtener la información necesaria, por lo que no es recomendable emplear una técnica más costosa o complicada. No obstante, si se requiere elaborar el mapa genético de una especie, la cantidad y precisión de la información requerida es mayor, por lo que necesariamente se debe recurrir a los marcadores de ADN.
También se debe considerar el costo en sí de la técnica que se va ha desarrollar, la necesidad de personal capacitado, el equipo, los reactivos y las instalaciones de laboratorio y condiciones de seguridad que requiere cada técnica (por ejemplo, en el caso de RFLP se necesita un depósito de desechos radiactivos). Es siempre recomendable analizar qué tanto trabajo previo es necesario para llevar a cabo una técnica (por ejemplo, las sondas en los RFLP). Finalmente, aunque no siempre es bueno limitarse, se debe ser realista y desarrollar las técnicas moleculares más adecuadas para nuestro estudio, que además se puedan realizar bajo las condiciones del laboratorio que disponemos.
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